Paléojura a pour objectif de faire connaître le patrimoine paléontologique jurassien au-delà des frontières cantonales. Les découvertes faites ces dernières années constituent une ressource pour la région d'Ajoie, apportant une valeur ajoutée au développement économique. A travers ce patrimoine, ce sont les atouts du Canton du Jura qui sont aussi mieux connus et valorisés.
Les traces de dinosaures, par leur nombre et leur préservation, constituent sans aucun doute la thématique la plus attractive pour attirer des visiteurs dans le Jura. La géologie du terrain facilite cette mise en valeur, les couches étant quasi horizontales. Néanmoins, sauf exception, la majorité des sites découverts sur le tracé autoroutier de l'A16 ne seront plus accessibles une fois la Transjuranne terminée. Ceci ouvre cependant la perspective à de nouveaux sites de fouilles sur le terrain, de dimensions sans doute plus modestes, mais assurant un renouvellement des découvertes et une interaction avec les visiteurs.
Heureusement, les découvertes ne se limitent pas aux seules empreintes de dinosaures, aussi fascinantes soient-elles. Le plateau autour de Courtedoux permet de découvrir et comprendre des plans entiers de l'histoire géologique de la région grâces aux autres couches fossilifères, comme les Marnes à virgula ou les Marnes du Banné. Ces niveaux sont riches en fossiles susceptibles d'intéresser les scientifiques et de fasciner le grand public, enfants et adultes.
Les fouilles paléontologiques, et leur maintien à long terme, sont donc une des perspectives clés pour la durabilité de la démarche de valorisation de paléojura. Elles sont garantes d'un renouvellement de l'intérêt pour les visiteurs, en complément des infrastructures d'accueil. Ces fouilles sont clairement liées à la présence d'un centre de compétence scientifique qui garantira la présence de ressources humaines pour la recherche et le savoir-faire technique.
L'interaction créée entre les scientifiques et les visiteurs permettra de garantir un renouvellement des découvertes, et l'envie de revenir visiter les expositions et ateliers pédagogiques proposés à Porrentruy et les sites de fouilles sur le terrain autour de Courtedoux.